| 실험방법 |
알레르겐과의 아미노산 서열 상동성 검색 방법 : 도입단백질의 아미노산 서열 상동성 검색은 SwissProt, PIR, PRF, PDB, InterPro, Pfam, WHO-IUIS 등의 알레르겐 데이터베이스를 기반으로 하는 AllergenOnline (최신DB)을 이용하여 기존 알레르겐과의 상동성 분석을 실시하며, 상동성 분석은 FAO/WHO에서 권장하는 방법에 따라 80개 또는 그 이상의 아미노산 펩타이드가 기지의 알레르겐 서열과 35% 이상 일치하는지를 알아보는 FASTA (sliding 80mer window)법과 8개의 연속된 아미노산 서열이 일치하는지를 알아보는 pattern match (8mer exact match)법을 사용하여 분석
--알레르겐과의 아미노산 서열 상동성 검색 결과의 해석 : 도입단백질의 아미노산 서열과 기존 알레르겐 아미노산 서열과의 상동성 분석은 80개 단위의 아미노산 서열이 35% 이상 일치하는 경우 또는 8개의 연속된 아미노산 서열이 일치하는 경우 상동성이 있는 것으로 판단 |
